Η κολονοσκόπηση είναι μια διαγνωστική εξέταση κατά την οποία ελέγχεται με άμεση όραση το εσωτερικό του παχέος εντέρου και των τελευταίων εκατοστών του λεπτού εντέρου. Η εξέταση γίνεται με εύκαμπτο ενδοσκόπιο -  κάμερα μετά από καταστολή του ασθενούς (μέθη). Η κάμερα του ενδοσκοπίου επιτρέπει στον ιατρό να εξετάσει σε υψηλή ευκρίνεια τον εσωτερικό βλεννογόνο του παχέος εντέρου. Μπορεί να πραγματοποιηθεί κολονοσκόπηση για τη διάγνωση της αιτίας των γαστρεντερικών συμπτωμάτων όπως διάρροια, αιμορραγία, κοιλιακός πόνος ή μη φυσιολογικά αποτελέσματα ακτινοδιαγνωστικών απεικονίσεων. Η κολονοσκόπηση μπορεί επίσης να πραγματοποιηθεί σε ασυμπτωματικό ασθενή σε ηλικία 50 ετών, ή νωρίτερα ανάλογα με το ιστορικό του ασθενούς, για προληπτικό έλεγχο για καρκίνο του παχέος εντέρου και τυχόν πολύποδων. Εάν βρεθούν πολύποδες παχέος εντέρου σε αρκετά πρώιμο στάδιο, μπορούν να αφαιρεθούν επιτόπου.